Uni Zürich nimmt Europas schnellsten AMD Supercomputer in Betrieb

Der Opteron-Cluster "Matterhorn" deckt Leistungsbedarf mehrerer Institute ab

Linux Cluster von DALCO an der ETH in Zürich

Volketswil, Schweiz (pts035/17.12.2003/21:53) Die Universität Zürich startet mit einem ausserordentlichen Leistungsschub im Bereich der wissenschaftlichen Berechnungen ins neue Jahr. Mit der Inbetriebnahme des "Matterhorn" Clusters im Dezember 2003 steht der Forschung in Zürich der europaweit mit Abstand schnellste Linux Supercomputer auf AMD Opteron Basis zur Verfügung. Gebaut und konzipiert wurde der mit 522 AMD Opteron Prozessoren bestückte Cluster von der Schweizer DALCO AG (http://www.dalco.ch), einem international führenden Spezialisten für Linux Supercomputer. Mit einer maximalen Rechengeschwindigkeit von 1872 Gigaflops (1872 Milliarden Fliesskomma-Operationen pro Sekunde) erreicht "Matterhorn" eine hohe Platzierung in der Top 500 Liste der weltweit schnellsten Computer (http://www.top500.org).

"Matterhorn" entstand als Gemeinschaftsprojekt der Informatikdienste der Universität Zürich zusammen mit den Instituten für Biochemie, organische Chemie, Physik, Geographie und des Functional Genomics Center Zürich. Chemiker und Biochemiker werden auf dem neuen Supercomputer Cluster in oft wochenlangen Berechnungen das Verhalten komplexer Moleküle simulieren und entschlüsseln. "Matterhorn" vereinfacht ihre Studien grundlegend, da Simulationen mit unterschiedlichen Parametern auf einem Cluster gleichzeitig durchgeführt werden können. Physiker berechnen das Verhalten ganzer Galaxien oder komplexe theoretische Sachverhalte und die Molekularbiologen des Functional Genomics Center analysieren neue Gensequenzen durch aufwändige Vergleiche mit riesigen Referenzdatenbanken.

"Die Rechenleistung, die wir den Instituten zur Verfügung stellen konnten, wurde für die Forscher immer mehr zum Engpass", erklärt Dr. Alexander Godknecht, der Verantwortliche für die zentralen Serverdienste der Universität Zürich. Die einzigartige AMD64 Architektur ermöglicht es dem Opteron Prozessor, sowohl 32-Bit als auch 64-Bit Applikationen zum ersten Mal simultan und mit voller Geschwindigkeit zu unterstützen. Durch den neuen Supercomputer sind die Forscher des Instituts nun in der Lage, ihre Ergebnisse um ein Vielfaches schneller, und mit einer viel höheren Genauigkeit zu ermitteln als zuvor.

Der neue Cluster mit 522 Prozessoren der Universität Zürich basiert auf Arima/Rioworks Server-Hauptplatinen, die mit je zwei AMD Opteron-Prozessoren (getaktet mit 1,8GHz) bestückt sind. Dazu kommen ein Gigabit Ethernet Netzwerk für den input/output Daten-verkehr sowie ein Service-Netzwerk; die einzelnen Knoten werden mit dem neuesten Highspeed Myrinet Interconnect (2+2 Gigabit pro Sekunde, voll bi-sektional) gekoppelt. Der Supercomputer verfügt über 522GByte Hochleistungs DDR333 Memory und eine Speicherkapazität von 15'000GByte verteilt auf 289 Festplatten. Alle Komponenten eines Rechen-Knotens wurden in ein spezielles, die Wärme optimal abführendes 45mm hohes Chassis integriert. Die Management-, Rechen-, und die drei Fileserver-Knoten sowie die komplexe Kommunikationsinfrastruktur sind in zehn System-Schränken untergebracht.

Über DALCO

Inhaber und Geschäftsführer der Schweizer DALCO AG sind die Brüder Dallmann. Das 1995 gegründete Unternehmen ist finanziell unabhängig und nicht an bestimmte Lieferanten gebunden. Dies ermöglicht es DALCO, exakt den Kundenbedürfnissen entsprechende Highend-Computinglösungen auf der Basis der besten jeweils verfügbaren Technologie zu entwickeln. Höchste Qualitätsanforderungen, die Erfüllung der spezifischen Kundenbedürfnisse und eine rasche Anpassung an sich ändernde Geschäfts-anforder-ungen bestimmen die Unternehmensphilosophie. Kunden können aus einer breiten Palette flexibler Lösungen auf der Basis von Intel oder AMD Prozessoren frei wählen. DALCOs preisgekrönter PLCC-Service (product life cycle care) ergänzt das Angebot. DALCO ist zudem der führende europäische Systemintegrator für Opteron-basierte Lösungen im Supercomputing-Bereich und der führende Lieferant von Linux-basierten Lösungen in der Schweiz.

http://www.dalco.ch http://www.supercomputer.ch

Über Universität Zürich

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Sie wurde im Jahre 1833 gegründet, ihre Wurzeln reichen jedoch zurück bis ins Jahr 1525 zum Reformator Ulrich Zwingli. Heute geniesst sie als Ausbildungs- und Forschungsstätte weltweites Ansehen. 2000 Dozierende sorgen an über 140 Instituten für das breiteste Bildungsangebot an einer schweizerischen Hochschule. Mit 21'000 Studierenden ist sie zudem die grösste Universität der Schweiz. Sie erbringt wissen-schaftliche Dienstleistungen, arbeitet mit der Privatwirtschaft zusammen und versteht sich als Teil des nationalen und globalen Netzwerks, das Wissen mehrt und vermittelt. Internationales Renommee verdankt die Universität Zürich Forschungserfolgen insbesondere in Molekularbiologie, Hirnforschung und Anthropologie sowie der Tätigkeit des Universitäts- und des Tierspitals.

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